Emmanuel Macron a qualifié la colonisation française en Algérie de « crime contre l’humanité », le 15 février à Alger. Ces propos ont suscité « l’incompréhension » de François Bayrou : le 22 février, lors d’une conférence de presse où il a formulé une offre d’alliance au candidat à l’élection présidentielle, le président du MoDem a tenu à expliquer les raisons de son désaccord sur ce point. Selon le maire de Pau, cette formule est « blessante pour de nombreux Français et ne correspond pas à la vérité historique ».